Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc8eQ66JT1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc8eQ66JT1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms