Protein–RNA interactions for Protein: Q64705

Usf2, Upstream stimulatory factor 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf2Q64705 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usf2Q64705 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usf2Q64705 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms