Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
Top2bQ64511 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Top2bQ64511 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Top2bQ64511 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Top2bQ64511 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Top2bQ64511 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Top2bQ64511 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Top2bQ64511 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Top2bQ64511 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Top2bQ64511 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Top2bQ64511 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Top2bQ64511 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Top2bQ64511 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Top2bQ64511 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Top2bQ64511 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Top2bQ64511 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Top2bQ64511 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Top2bQ64511 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Top2bQ64511 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Top2bQ64511 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Top2bQ64511 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Top2bQ64511 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Top2bQ64511 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Top2bQ64511 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Top2bQ64511 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Top2bQ64511 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Top2bQ64511 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Top2bQ64511 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Top2bQ64511 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Top2bQ64511 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Top2bQ64511 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Top2bQ64511 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Top2bQ64511 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Top2bQ64511 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Top2bQ64511 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Top2bQ64511 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Top2bQ64511 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Top2bQ64511 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Top2bQ64511 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Top2bQ64511 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Top2bQ64511 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Top2bQ64511 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
Top2bQ64511 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
Top2bQ64511 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Top2bQ64511 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Top2bQ64511 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Top2bQ64511 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Top2bQ64511 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Top2bQ64511 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Top2bQ64511 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Top2bQ64511 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Top2bQ64511 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Top2bQ64511 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Top2bQ64511 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Top2bQ64511 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Top2bQ64511 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Top2bQ64511 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Top2bQ64511 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Top2bQ64511 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Top2bQ64511 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Top2bQ64511 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Top2bQ64511 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Top2bQ64511 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Top2bQ64511 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Top2bQ64511 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Top2bQ64511 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Top2bQ64511 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Top2bQ64511 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Top2bQ64511 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Top2bQ64511 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Top2bQ64511 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Top2bQ64511 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Top2bQ64511 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Top2bQ64511 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Top2bQ64511 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Top2bQ64511 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Top2bQ64511 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Top2bQ64511 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Top2bQ64511 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Top2bQ64511 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Top2bQ64511 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Top2bQ64511 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Top2bQ64511 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Top2bQ64511 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Top2bQ64511 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Top2bQ64511 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Top2bQ64511 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Top2bQ64511 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Top2bQ64511 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Top2bQ64511 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Top2bQ64511 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Top2bQ64511 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Top2bQ64511 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Top2bQ64511 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Top2bQ64511 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Top2bQ64511 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Top2bQ64511 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Top2bQ64511 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Top2bQ64511 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
Top2bQ64511 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms