Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gja3Q64448 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Gja3Q64448 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gja3Q64448 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gja3Q64448 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gja3Q64448 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gja3Q64448 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gja3Q64448 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gja3Q64448 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gja3Q64448 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gja3Q64448 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gja3Q64448 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gja3Q64448 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gja3Q64448 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gja3Q64448 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gja3Q64448 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gja3Q64448 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gja3Q64448 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gja3Q64448 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gja3Q64448 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gja3Q64448 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gja3Q64448 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gja3Q64448 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gja3Q64448 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gja3Q64448 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gja3Q64448 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gja3Q64448 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gja3Q64448 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gja3Q64448 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gja3Q64448 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gja3Q64448 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gja3Q64448 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gja3Q64448 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gja3Q64448 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gja3Q64448 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gja3Q64448 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms