Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Surf4Q64310 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms