Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim24Q64127 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim24Q64127 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim24Q64127 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim24Q64127 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim24Q64127 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim24Q64127 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim24Q64127 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim24Q64127 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim24Q64127 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim24Q64127 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trim24Q64127 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim24Q64127 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim24Q64127 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim24Q64127 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim24Q64127 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim24Q64127 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim24Q64127 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim24Q64127 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim24Q64127 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim24Q64127 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim24Q64127 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trim24Q64127 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim24Q64127 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim24Q64127 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim24Q64127 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim24Q64127 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim24Q64127 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim24Q64127 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim24Q64127 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim24Q64127 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim24Q64127 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim24Q64127 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim24Q64127 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim24Q64127 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim24Q64127 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim24Q64127 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim24Q64127 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim24Q64127 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim24Q64127 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim24Q64127 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trim24Q64127 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim24Q64127 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trim24Q64127 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim24Q64127 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms