Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pan3Q640Q5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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