Protein–RNA interactions for Protein: Q62513

Znf260, Zinc finger protein 260, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf260Q62513 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Znf260Q62513 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Znf260Q62513 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Znf260Q62513 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Znf260Q62513 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf260Q62513 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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