Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Itga3Q62470 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Itga3Q62470 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Itga3Q62470 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Itga3Q62470 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Itga3Q62470 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Itga3Q62470 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Itga3Q62470 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Itga3Q62470 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Itga3Q62470 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Itga3Q62470 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Itga3Q62470 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Itga3Q62470 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Itga3Q62470 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms