Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vil1Q62468 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vil1Q62468 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vil1Q62468 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vil1Q62468 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vil1Q62468 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vil1Q62468 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vil1Q62468 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Vil1Q62468 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Vil1Q62468 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vil1Q62468 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vil1Q62468 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vil1Q62468 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vil1Q62468 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vil1Q62468 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vil1Q62468 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vil1Q62468 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vil1Q62468 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Vil1Q62468 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vil1Q62468 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vil1Q62468 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vil1Q62468 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Vil1Q62468 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vil1Q62468 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vil1Q62468 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vil1Q62468 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vil1Q62468 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vil1Q62468 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vil1Q62468 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vil1Q62468 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vil1Q62468 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vil1Q62468 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vil1Q62468 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vil1Q62468 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vil1Q62468 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vil1Q62468 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vil1Q62468 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vil1Q62468 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vil1Q62468 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vil1Q62468 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vil1Q62468 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vil1Q62468 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vil1Q62468 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Vil1Q62468 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vil1Q62468 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vil1Q62468 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vil1Q62468 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Vil1Q62468 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vil1Q62468 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vil1Q62468 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vil1Q62468 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vil1Q62468 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Vil1Q62468 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vil1Q62468 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vil1Q62468 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Vil1Q62468 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vil1Q62468 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vil1Q62468 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vil1Q62468 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vil1Q62468 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vil1Q62468 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vil1Q62468 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vil1Q62468 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vil1Q62468 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vil1Q62468 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vil1Q62468 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vil1Q62468 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vil1Q62468 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vil1Q62468 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vil1Q62468 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vil1Q62468 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vil1Q62468 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vil1Q62468 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vil1Q62468 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vil1Q62468 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vil1Q62468 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vil1Q62468 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vil1Q62468 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Vil1Q62468 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vil1Q62468 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vil1Q62468 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vil1Q62468 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vil1Q62468 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vil1Q62468 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Vil1Q62468 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vil1Q62468 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vil1Q62468 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vil1Q62468 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Vil1Q62468 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vil1Q62468 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vil1Q62468 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Vil1Q62468 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vil1Q62468 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vil1Q62468 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vil1Q62468 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vil1Q62468 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vil1Q62468 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vil1Q62468 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vil1Q62468 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vil1Q62468 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms