Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vat1Q62465 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms