Protein–RNA interactions for Protein: Q62441

Tle4, Transducin-like enhancer protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tle4Q62441 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tle4Q62441 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tle4Q62441 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tle4Q62441 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tle4Q62441 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tle4Q62441 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tle4Q62441 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tle4Q62441 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tle4Q62441 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tle4Q62441 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tle4Q62441 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tle4Q62441 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms