Protein–RNA interactions for Protein: Q62395

Tff3, Trefoil factor 3, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff3Q62395 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tff3Q62395 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tff3Q62395 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tff3Q62395 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tff3Q62395 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tff3Q62395 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tff3Q62395 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tff3Q62395 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tff3Q62395 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tff3Q62395 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tff3Q62395 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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Tff3Q62395 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tff3Q62395 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tff3Q62395 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tff3Q62395 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tff3Q62395 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tff3Q62395 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tff3Q62395 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tff3Q62395 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tff3Q62395 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tff3Q62395 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tff3Q62395 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tff3Q62395 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tff3Q62395 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tff3Q62395 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tff3Q62395 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tff3Q62395 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tff3Q62395 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tff3Q62395 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tff3Q62395 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Tff3Q62395 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tff3Q62395 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tff3Q62395 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tff3Q62395 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Tff3Q62395 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tff3Q62395 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tff3Q62395 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Tff3Q62395 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Tff3Q62395 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Tff3Q62395 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tff3Q62395 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tff3Q62395 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tff3Q62395 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tff3Q62395 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Tff3Q62395 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tff3Q62395 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tff3Q62395 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tff3Q62395 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tff3Q62395 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Tff3Q62395 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Tff3Q62395 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tff3Q62395 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tff3Q62395 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tff3Q62395 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tff3Q62395 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tff3Q62395 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tff3Q62395 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tff3Q62395 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tff3Q62395 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tff3Q62395 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tff3Q62395 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tff3Q62395 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tff3Q62395 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tff3Q62395 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tff3Q62395 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tff3Q62395 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tff3Q62395 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tff3Q62395 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tff3Q62395 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tff3Q62395 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tff3Q62395 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tff3Q62395 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tff3Q62395 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Tff3Q62395 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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