Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TrhQ62361 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TrhQ62361 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TrhQ62361 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TrhQ62361 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TrhQ62361 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TrhQ62361 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TrhQ62361 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TrhQ62361 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TrhQ62361 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TrhQ62361 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TrhQ62361 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TrhQ62361 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TrhQ62361 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TrhQ62361 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TrhQ62361 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TrhQ62361 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TrhQ62361 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TrhQ62361 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TrhQ62361 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TrhQ62361 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TrhQ62361 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TrhQ62361 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TrhQ62361 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TrhQ62361 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TrhQ62361 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TrhQ62361 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TrhQ62361 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TrhQ62361 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TrhQ62361 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TrhQ62361 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TrhQ62361 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TrhQ62361 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TrhQ62361 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TrhQ62361 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TrhQ62361 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TrhQ62361 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TrhQ62361 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TrhQ62361 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TrhQ62361 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TrhQ62361 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TrhQ62361 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TrhQ62361 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TrhQ62361 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TrhQ62361 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TrhQ62361 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TrhQ62361 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TrhQ62361 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TrhQ62361 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TrhQ62361 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TrhQ62361 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TrhQ62361 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TrhQ62361 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TrhQ62361 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TrhQ62361 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TrhQ62361 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TrhQ62361 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TrhQ62361 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TrhQ62361 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TrhQ62361 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TrhQ62361 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TrhQ62361 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TrhQ62361 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TrhQ62361 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TrhQ62361 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TrhQ62361 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TrhQ62361 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TrhQ62361 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TrhQ62361 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TrhQ62361 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TrhQ62361 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TrhQ62361 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TrhQ62361 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TrhQ62361 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TrhQ62361 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TrhQ62361 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TrhQ62361 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TrhQ62361 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TrhQ62361 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TrhQ62361 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TrhQ62361 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TrhQ62361 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TrhQ62361 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TrhQ62361 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TrhQ62361 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TrhQ62361 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TrhQ62361 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TrhQ62361 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TrhQ62361 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TrhQ62361 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TrhQ62361 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TrhQ62361 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TrhQ62361 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TrhQ62361 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TrhQ62361 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TrhQ62361 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TrhQ62361 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TrhQ62361 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TrhQ62361 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TrhQ62361 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms