Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Taf6Q62311 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf6Q62311 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms