Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ss18Q62280 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ss18Q62280 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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