Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SypQ62277 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SypQ62277 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SypQ62277 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SypQ62277 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SypQ62277 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SypQ62277 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SypQ62277 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SypQ62277 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SypQ62277 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SypQ62277 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SypQ62277 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SypQ62277 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SypQ62277 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SypQ62277 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SypQ62277 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SypQ62277 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SypQ62277 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SypQ62277 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SypQ62277 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SypQ62277 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SypQ62277 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SypQ62277 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SypQ62277 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SypQ62277 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SypQ62277 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SypQ62277 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SypQ62277 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SypQ62277 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SypQ62277 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SypQ62277 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SypQ62277 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SypQ62277 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SypQ62277 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SypQ62277 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SypQ62277 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SypQ62277 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SypQ62277 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SypQ62277 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SypQ62277 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SypQ62277 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SypQ62277 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SypQ62277 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SypQ62277 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SypQ62277 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SypQ62277 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SypQ62277 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SypQ62277 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SypQ62277 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SypQ62277 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SypQ62277 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SypQ62277 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SypQ62277 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SypQ62277 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SypQ62277 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SypQ62277 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SypQ62277 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SypQ62277 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SypQ62277 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SypQ62277 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SypQ62277 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SypQ62277 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SypQ62277 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SypQ62277 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SypQ62277 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SypQ62277 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SypQ62277 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SypQ62277 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SypQ62277 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SypQ62277 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SypQ62277 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SypQ62277 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SypQ62277 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SypQ62277 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SypQ62277 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SypQ62277 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SypQ62277 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SypQ62277 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SypQ62277 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SypQ62277 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SypQ62277 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SypQ62277 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SypQ62277 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SypQ62277 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SypQ62277 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SypQ62277 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SypQ62277 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SypQ62277 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SypQ62277 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SypQ62277 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SypQ62277 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SypQ62277 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SypQ62277 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SypQ62277 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SypQ62277 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SypQ62277 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SypQ62277 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SypQ62277 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SypQ62277 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SypQ62277 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms