Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sall3Q62255 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Sall3Q62255 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sall3Q62255 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sall3Q62255 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sall3Q62255 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sall3Q62255 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sall3Q62255 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Sall3Q62255 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sall3Q62255 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sall3Q62255 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sall3Q62255 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sall3Q62255 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sall3Q62255 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sall3Q62255 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sall3Q62255 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sall3Q62255 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sall3Q62255 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sall3Q62255 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sall3Q62255 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sall3Q62255 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sall3Q62255 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sall3Q62255 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sall3Q62255 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sall3Q62255 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Sall3Q62255 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sall3Q62255 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sall3Q62255 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sall3Q62255 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sall3Q62255 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sall3Q62255 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sall3Q62255 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sall3Q62255 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sall3Q62255 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sall3Q62255 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sall3Q62255 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sall3Q62255 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sall3Q62255 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sall3Q62255 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sall3Q62255 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sall3Q62255 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sall3Q62255 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sall3Q62255 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sall3Q62255 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sall3Q62255 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sall3Q62255 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sall3Q62255 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sall3Q62255 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sall3Q62255 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sall3Q62255 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sall3Q62255 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Sall3Q62255 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Sall3Q62255 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Sall3Q62255 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sall3Q62255 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sall3Q62255 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sall3Q62255 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sall3Q62255 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sall3Q62255 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sall3Q62255 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sall3Q62255 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Sall3Q62255 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sall3Q62255 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sall3Q62255 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sall3Q62255 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sall3Q62255 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sall3Q62255 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sall3Q62255 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sall3Q62255 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sall3Q62255 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sall3Q62255 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sall3Q62255 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sall3Q62255 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sall3Q62255 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sall3Q62255 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sall3Q62255 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sall3Q62255 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sall3Q62255 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sall3Q62255 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sall3Q62255 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sall3Q62255 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sall3Q62255 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sall3Q62255 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sall3Q62255 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sall3Q62255 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sall3Q62255 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sall3Q62255 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sall3Q62255 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sall3Q62255 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sall3Q62255 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sall3Q62255 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Sall3Q62255 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sall3Q62255 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sall3Q62255 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sall3Q62255 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sall3Q62255 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sall3Q62255 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sall3Q62255 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sall3Q62255 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sall3Q62255 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms