Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttf1Q62187 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttf1Q62187 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttf1Q62187 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttf1Q62187 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttf1Q62187 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttf1Q62187 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttf1Q62187 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttf1Q62187 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttf1Q62187 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttf1Q62187 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttf1Q62187 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttf1Q62187 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ttf1Q62187 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttf1Q62187 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttf1Q62187 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttf1Q62187 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttf1Q62187 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttf1Q62187 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttf1Q62187 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttf1Q62187 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttf1Q62187 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttf1Q62187 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttf1Q62187 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttf1Q62187 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttf1Q62187 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttf1Q62187 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttf1Q62187 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttf1Q62187 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttf1Q62187 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttf1Q62187 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttf1Q62187 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttf1Q62187 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttf1Q62187 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttf1Q62187 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttf1Q62187 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttf1Q62187 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttf1Q62187 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms