Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sin3bQ62141 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sin3bQ62141 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms