Protein–RNA interactions for Protein: Q62035

Ptafr, Platelet-activating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtafrQ62035 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PtafrQ62035 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms