Protein–RNA interactions for Protein: Q61923

Kcna6, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 6, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna6Q61923 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kcna6Q61923 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kcna6Q61923 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kcna6Q61923 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Kcna6Q61923 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kcna6Q61923 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kcna6Q61923 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kcna6Q61923 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kcna6Q61923 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kcna6Q61923 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kcna6Q61923 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kcna6Q61923 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kcna6Q61923 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kcna6Q61923 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kcna6Q61923 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kcna6Q61923 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcna6Q61923 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcna6Q61923 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcna6Q61923 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcna6Q61923 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcna6Q61923 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcna6Q61923 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcna6Q61923 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcna6Q61923 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcna6Q61923 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcna6Q61923 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcna6Q61923 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcna6Q61923 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcna6Q61923 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Kcna6Q61923 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kcna6Q61923 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kcna6Q61923 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kcna6Q61923 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kcna6Q61923 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kcna6Q61923 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kcna6Q61923 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kcna6Q61923 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kcna6Q61923 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kcna6Q61923 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kcna6Q61923 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kcna6Q61923 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kcna6Q61923 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kcna6Q61923 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kcna6Q61923 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kcna6Q61923 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kcna6Q61923 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kcna6Q61923 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kcna6Q61923 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Kcna6Q61923 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kcna6Q61923 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Kcna6Q61923 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kcna6Q61923 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kcna6Q61923 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kcna6Q61923 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kcna6Q61923 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Kcna6Q61923 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kcna6Q61923 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kcna6Q61923 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kcna6Q61923 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kcna6Q61923 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kcna6Q61923 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kcna6Q61923 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kcna6Q61923 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kcna6Q61923 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kcna6Q61923 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kcna6Q61923 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kcna6Q61923 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kcna6Q61923 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Kcna6Q61923 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kcna6Q61923 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kcna6Q61923 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kcna6Q61923 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kcna6Q61923 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kcna6Q61923 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Kcna6Q61923 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Kcna6Q61923 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Kcna6Q61923 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kcna6Q61923 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kcna6Q61923 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Kcna6Q61923 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kcna6Q61923 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kcna6Q61923 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kcna6Q61923 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kcna6Q61923 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kcna6Q61923 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kcna6Q61923 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kcna6Q61923 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kcna6Q61923 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kcna6Q61923 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kcna6Q61923 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kcna6Q61923 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kcna6Q61923 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kcna6Q61923 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kcna6Q61923 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kcna6Q61923 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kcna6Q61923 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kcna6Q61923 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kcna6Q61923 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kcna6Q61923 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kcna6Q61923 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms