Protein–RNA interactions for Protein: Q61718

Ifna15, Alpha-interferon, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna15Q61718 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna15Q61718 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifna15Q61718 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifna15Q61718 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms