Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
AtrxQ61687 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms