Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcd2Q61285 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcd2Q61285 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcd2Q61285 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcd2Q61285 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcd2Q61285 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcd2Q61285 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcd2Q61285 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcd2Q61285 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcd2Q61285 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcd2Q61285 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcd2Q61285 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcd2Q61285 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcd2Q61285 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcd2Q61285 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcd2Q61285 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcd2Q61285 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcd2Q61285 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcd2Q61285 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcd2Q61285 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcd2Q61285 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcd2Q61285 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcd2Q61285 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcd2Q61285 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcd2Q61285 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcd2Q61285 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcd2Q61285 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcd2Q61285 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcd2Q61285 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcd2Q61285 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcd2Q61285 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcd2Q61285 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcd2Q61285 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcd2Q61285 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcd2Q61285 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcd2Q61285 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcd2Q61285 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcd2Q61285 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcd2Q61285 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcd2Q61285 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcd2Q61285 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcd2Q61285 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcd2Q61285 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcd2Q61285 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcd2Q61285 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcd2Q61285 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcd2Q61285 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcd2Q61285 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcd2Q61285 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcd2Q61285 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcd2Q61285 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcd2Q61285 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcd2Q61285 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcd2Q61285 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcd2Q61285 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcd2Q61285 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcd2Q61285 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcd2Q61285 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms