Protein–RNA interactions for Protein: Q61043

Nin, Ninein, mousemouse

Predictions only

Length 2,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinQ61043 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NinQ61043 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NinQ61043 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NinQ61043 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NinQ61043 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NinQ61043 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NinQ61043 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NinQ61043 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NinQ61043 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NinQ61043 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NinQ61043 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NinQ61043 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NinQ61043 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NinQ61043 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NinQ61043 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NinQ61043 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NinQ61043 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NinQ61043 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NinQ61043 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NinQ61043 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NinQ61043 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NinQ61043 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NinQ61043 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NinQ61043 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NinQ61043 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NinQ61043 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NinQ61043 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NinQ61043 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NinQ61043 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NinQ61043 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NinQ61043 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NinQ61043 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NinQ61043 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NinQ61043 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NinQ61043 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NinQ61043 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NinQ61043 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NinQ61043 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NinQ61043 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NinQ61043 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NinQ61043 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NinQ61043 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NinQ61043 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NinQ61043 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NinQ61043 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NinQ61043 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NinQ61043 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NinQ61043 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NinQ61043 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NinQ61043 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NinQ61043 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
NinQ61043 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NinQ61043 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NinQ61043 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NinQ61043 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NinQ61043 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NinQ61043 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NinQ61043 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NinQ61043 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NinQ61043 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NinQ61043 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NinQ61043 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NinQ61043 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NinQ61043 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NinQ61043 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NinQ61043 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NinQ61043 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NinQ61043 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NinQ61043 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NinQ61043 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NinQ61043 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NinQ61043 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NinQ61043 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NinQ61043 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NinQ61043 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NinQ61043 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NinQ61043 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NinQ61043 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NinQ61043 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NinQ61043 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NinQ61043 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NinQ61043 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NinQ61043 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NinQ61043 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NinQ61043 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NinQ61043 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NinQ61043 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NinQ61043 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NinQ61043 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NinQ61043 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NinQ61043 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NinQ61043 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NinQ61043 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NinQ61043 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NinQ61043 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NinQ61043 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NinQ61043 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NinQ61043 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NinQ61043 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
NinQ61043 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms