Protein–RNA interactions for Protein: Q61025

Ift20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift20Q61025 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ift20Q61025 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ift20Q61025 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms