Protein–RNA interactions for Protein: Q61001

Lama5, Laminin subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 3,718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama5Q61001 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lama5Q61001 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lama5Q61001 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lama5Q61001 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lama5Q61001 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lama5Q61001 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lama5Q61001 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lama5Q61001 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lama5Q61001 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Lama5Q61001 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lama5Q61001 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lama5Q61001 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lama5Q61001 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lama5Q61001 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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