Protein–RNA interactions for Protein: Q60987

Foxg1, Forkhead box protein G1, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxg1Q60987 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxg1Q60987 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms