Protein–RNA interactions for Protein: Q60954

Meis1, Homeobox protein Meis1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis1Q60954 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Meis1Q60954 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Meis1Q60954 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms