Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grik1Q60934 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grik1Q60934 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grik1Q60934 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grik1Q60934 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grik1Q60934 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grik1Q60934 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Grik1Q60934 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grik1Q60934 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grik1Q60934 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Grik1Q60934 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grik1Q60934 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grik1Q60934 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grik1Q60934 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grik1Q60934 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Grik1Q60934 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grik1Q60934 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grik1Q60934 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grik1Q60934 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grik1Q60934 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grik1Q60934 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grik1Q60934 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grik1Q60934 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grik1Q60934 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grik1Q60934 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grik1Q60934 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grik1Q60934 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grik1Q60934 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grik1Q60934 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grik1Q60934 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grik1Q60934 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Grik1Q60934 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Grik1Q60934 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms