Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tnfrsf8Q60846 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tnfrsf8Q60846 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms