Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Mkrn3Q60764 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms