Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Samhd1Q60710 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms