Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf123Q5XPI3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf123Q5XPI3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf123Q5XPI3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf123Q5XPI3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf123Q5XPI3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf123Q5XPI3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf123Q5XPI3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf123Q5XPI3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf123Q5XPI3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf123Q5XPI3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf123Q5XPI3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf123Q5XPI3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf123Q5XPI3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf123Q5XPI3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf123Q5XPI3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf123Q5XPI3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Rnf123Q5XPI3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rnf123Q5XPI3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rnf123Q5XPI3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Rnf123Q5XPI3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rnf123Q5XPI3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rnf123Q5XPI3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Rnf123Q5XPI3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Rnf123Q5XPI3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf123Q5XPI3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms