Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tdrd5Q5VCS6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Tdrd5Q5VCS6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tdrd5Q5VCS6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tdrd5Q5VCS6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tdrd5Q5VCS6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tdrd5Q5VCS6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tdrd5Q5VCS6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tdrd5Q5VCS6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Tdrd5Q5VCS6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tdrd5Q5VCS6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tdrd5Q5VCS6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tdrd5Q5VCS6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tdrd5Q5VCS6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tdrd5Q5VCS6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tdrd5Q5VCS6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tdrd5Q5VCS6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Tdrd5Q5VCS6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tdrd5Q5VCS6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tdrd5Q5VCS6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tdrd5Q5VCS6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tdrd5Q5VCS6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tdrd5Q5VCS6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tdrd5Q5VCS6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tdrd5Q5VCS6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tdrd5Q5VCS6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tdrd5Q5VCS6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tdrd5Q5VCS6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Tdrd5Q5VCS6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tdrd5Q5VCS6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tdrd5Q5VCS6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tdrd5Q5VCS6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tdrd5Q5VCS6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tdrd5Q5VCS6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tdrd5Q5VCS6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tdrd5Q5VCS6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tdrd5Q5VCS6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tdrd5Q5VCS6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tdrd5Q5VCS6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tdrd5Q5VCS6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tdrd5Q5VCS6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tdrd5Q5VCS6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tdrd5Q5VCS6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tdrd5Q5VCS6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tdrd5Q5VCS6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tdrd5Q5VCS6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tdrd5Q5VCS6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tdrd5Q5VCS6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms