Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZT6

Zkscan4, MCG23028, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan4Q5SZT6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zkscan4Q5SZT6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zkscan4Q5SZT6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zkscan4Q5SZT6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Zkscan4Q5SZT6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms