Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TefmQ5SSK3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TefmQ5SSK3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms