Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Bhlha9Q5RJB0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlha9Q5RJB0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms