Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC48

Gm12253, Predicted gene 12253, mousemouse

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12253Q5NC48 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm12253Q5NC48 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm12253Q5NC48 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm12253Q5NC48 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm12253Q5NC48 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm12253Q5NC48 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm12253Q5NC48 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm12253Q5NC48 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm12253Q5NC48 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm12253Q5NC48 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm12253Q5NC48 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm12253Q5NC48 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm12253Q5NC48 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm12253Q5NC48 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm12253Q5NC48 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm12253Q5NC48 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm12253Q5NC48 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm12253Q5NC48 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm12253Q5NC48 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm12253Q5NC48 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm12253Q5NC48 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm12253Q5NC48 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm12253Q5NC48 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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