Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC41

1810065E05Rik, RIKEN cDNA 1810065E05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810065E05RikQ5NC41 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
1810065E05RikQ5NC41 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
1810065E05RikQ5NC41 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
1810065E05RikQ5NC41 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
1810065E05RikQ5NC41 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
1810065E05RikQ5NC41 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
1810065E05RikQ5NC41 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
1810065E05RikQ5NC41 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1810065E05RikQ5NC41 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1810065E05RikQ5NC41 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1810065E05RikQ5NC41 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1810065E05RikQ5NC41 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
1810065E05RikQ5NC41 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1810065E05RikQ5NC41 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1810065E05RikQ5NC41 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1810065E05RikQ5NC41 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1810065E05RikQ5NC41 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1810065E05RikQ5NC41 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
1810065E05RikQ5NC41 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1810065E05RikQ5NC41 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
1810065E05RikQ5NC41 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
1810065E05RikQ5NC41 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
1810065E05RikQ5NC41 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
1810065E05RikQ5NC41 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms