Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rtl5Q5DTT4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rtl5Q5DTT4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rtl5Q5DTT4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rtl5Q5DTT4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rtl5Q5DTT4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rtl5Q5DTT4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rtl5Q5DTT4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rtl5Q5DTT4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Rtl5Q5DTT4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rtl5Q5DTT4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rtl5Q5DTT4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rtl5Q5DTT4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rtl5Q5DTT4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rtl5Q5DTT4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rtl5Q5DTT4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rtl5Q5DTT4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Rtl5Q5DTT4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rtl5Q5DTT4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rtl5Q5DTT4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rtl5Q5DTT4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rtl5Q5DTT4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rtl5Q5DTT4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rtl5Q5DTT4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rtl5Q5DTT4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rtl5Q5DTT4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rtl5Q5DTT4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Rtl5Q5DTT4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rtl5Q5DTT4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rtl5Q5DTT4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rtl5Q5DTT4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rtl5Q5DTT4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rtl5Q5DTT4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rtl5Q5DTT4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rtl5Q5DTT4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rtl5Q5DTT4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rtl5Q5DTT4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Rtl5Q5DTT4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rtl5Q5DTT4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rtl5Q5DTT4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rtl5Q5DTT4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rtl5Q5DTT4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rtl5Q5DTT4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rtl5Q5DTT4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rtl5Q5DTT4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rtl5Q5DTT4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rtl5Q5DTT4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rtl5Q5DTT4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rtl5Q5DTT4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Rtl5Q5DTT4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rtl5Q5DTT4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rtl5Q5DTT4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rtl5Q5DTT4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rtl5Q5DTT4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Rtl5Q5DTT4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms