Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2f8Q58FA4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
E2f8Q58FA4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
E2f8Q58FA4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
E2f8Q58FA4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
E2f8Q58FA4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2f8Q58FA4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
E2f8Q58FA4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2f8Q58FA4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2f8Q58FA4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2f8Q58FA4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2f8Q58FA4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2f8Q58FA4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2f8Q58FA4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2f8Q58FA4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
E2f8Q58FA4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2f8Q58FA4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2f8Q58FA4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2f8Q58FA4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2f8Q58FA4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2f8Q58FA4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2f8Q58FA4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2f8Q58FA4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2f8Q58FA4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2f8Q58FA4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2f8Q58FA4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2f8Q58FA4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
E2f8Q58FA4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
E2f8Q58FA4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2f8Q58FA4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2f8Q58FA4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2f8Q58FA4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2f8Q58FA4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2f8Q58FA4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms