Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Spire1Q52KF3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Spire1Q52KF3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms