Protein–RNA interactions for Protein: Q505D1

Ankrd28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd28Q505D1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ankrd28Q505D1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ankrd28Q505D1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ankrd28Q505D1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ankrd28Q505D1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ankrd28Q505D1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ankrd28Q505D1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ankrd28Q505D1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ankrd28Q505D1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms