Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL18

Tmem171, Transmembrane protein 171, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem171Q4KL18 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tmem171Q4KL18 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem171Q4KL18 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms