Protein–RNA interactions for Protein: Q4FK66

Prpf38a, Pre-mRNA-splicing factor 38A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf38aQ4FK66 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prpf38aQ4FK66 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prpf38aQ4FK66 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prpf38aQ4FK66 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prpf38aQ4FK66 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prpf38aQ4FK66 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prpf38aQ4FK66 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prpf38aQ4FK66 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prpf38aQ4FK66 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prpf38aQ4FK66 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prpf38aQ4FK66 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prpf38aQ4FK66 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prpf38aQ4FK66 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prpf38aQ4FK66 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prpf38aQ4FK66 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prpf38aQ4FK66 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prpf38aQ4FK66 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prpf38aQ4FK66 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prpf38aQ4FK66 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prpf38aQ4FK66 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prpf38aQ4FK66 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prpf38aQ4FK66 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms