Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc43Q3V0L5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrrc43Q3V0L5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc43Q3V0L5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc43Q3V0L5 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc43Q3V0L5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc43Q3V0L5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc43Q3V0L5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc43Q3V0L5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc43Q3V0L5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc43Q3V0L5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc43Q3V0L5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc43Q3V0L5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrrc43Q3V0L5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc43Q3V0L5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc43Q3V0L5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc43Q3V0L5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc43Q3V0L5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc43Q3V0L5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc43Q3V0L5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc43Q3V0L5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc43Q3V0L5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc43Q3V0L5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc43Q3V0L5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc43Q3V0L5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc43Q3V0L5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc43Q3V0L5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrrc43Q3V0L5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Lrrc43Q3V0L5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc43Q3V0L5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc43Q3V0L5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc43Q3V0L5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc43Q3V0L5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc43Q3V0L5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc43Q3V0L5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc43Q3V0L5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc43Q3V0L5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc43Q3V0L5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc43Q3V0L5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc43Q3V0L5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc43Q3V0L5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc43Q3V0L5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc43Q3V0L5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc43Q3V0L5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc43Q3V0L5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc43Q3V0L5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc43Q3V0L5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc43Q3V0L5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc43Q3V0L5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc43Q3V0L5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc43Q3V0L5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc43Q3V0L5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc43Q3V0L5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc43Q3V0L5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc43Q3V0L5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc43Q3V0L5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc43Q3V0L5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc43Q3V0L5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc43Q3V0L5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc43Q3V0L5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc43Q3V0L5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc43Q3V0L5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc43Q3V0L5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc43Q3V0L5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc43Q3V0L5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc43Q3V0L5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc43Q3V0L5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc43Q3V0L5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc43Q3V0L5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc43Q3V0L5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc43Q3V0L5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc43Q3V0L5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc43Q3V0L5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc43Q3V0L5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc43Q3V0L5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc43Q3V0L5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc43Q3V0L5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc43Q3V0L5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc43Q3V0L5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc43Q3V0L5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc43Q3V0L5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc43Q3V0L5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc43Q3V0L5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc43Q3V0L5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc43Q3V0L5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc43Q3V0L5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc43Q3V0L5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc43Q3V0L5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc43Q3V0L5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc43Q3V0L5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc43Q3V0L5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc43Q3V0L5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc43Q3V0L5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc43Q3V0L5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc43Q3V0L5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc43Q3V0L5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc43Q3V0L5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc43Q3V0L5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms