Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc27Q3V036 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc27Q3V036 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc27Q3V036 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms