Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZV7

UPF0577 protein KIAA1324-like homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UZV7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UZV7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3UZV7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3UZV7 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3UZV7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3UZV7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3UZV7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3UZV7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Q3UZV7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3UZV7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3UZV7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3UZV7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3UZV7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3UZV7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3UZV7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3UZV7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3UZV7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3UZV7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3UZV7 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3UZV7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3UZV7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3UZV7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3UZV7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3UZV7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3UZV7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3UZV7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3UZV7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3UZV7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3UZV7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3UZV7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3UZV7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3UZV7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms